Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APBA1Q02410 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms