Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POU5F1Q01860 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms