Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRF9Q00978 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRF9Q00978 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF9Q00978 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF9Q00978 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF9Q00978 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IRF9Q00978 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IRF9Q00978 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF9Q00978 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IRF9Q00978 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF9Q00978 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
IRF9Q00978 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF9Q00978 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF9Q00978 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF9Q00978 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IRF9Q00978 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IRF9Q00978 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms