Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IRX1P78414 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IRX1P78414 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms