Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
HERVK_113P63121 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms