Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ERVFC1P60507 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms