Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPAP53621 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPAP53621 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
COPAP53621 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms