Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TTPAP49638 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTPAP49638 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTPAP49638 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTPAP49638 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTPAP49638 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TTPAP49638 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TTPAP49638 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TTPAP49638 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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