Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NESP48681 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NESP48681 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NESP48681 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NESP48681 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NESP48681 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NESP48681 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NESP48681 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NESP48681 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NESP48681 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NESP48681 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NESP48681 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NESP48681 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NESP48681 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NESP48681 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NESP48681 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NESP48681 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NESP48681 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms