Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NEDD4P46934 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms