Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CDKN1BP46527 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms