Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MDH1P40925 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MDH1P40925 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MDH1P40925 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms