Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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CASQ1P31415 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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CASQ1P31415 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CASQ1P31415 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CASQ1P31415 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CASQ1P31415 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CASQ1P31415 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CASQ1P31415 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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