Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTSSP25774 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms