Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HLA-DPA1P20036 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms