Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TCP1P17987 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCP1P17987 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCP1P17987 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCP1P17987 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCP1P17987 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCP1P17987 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCP1P17987 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCP1P17987 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCP1P17987 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCP1P17987 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCP1P17987 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TCP1P17987 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TCP1P17987 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms