Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
AMD1P17707 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
AMD1P17707 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AMD1P17707 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
AMD1P17707 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
AMD1P17707 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AMD1P17707 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
AMD1P17707 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AMD1P17707 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AMD1P17707 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms