Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC192P0DO97 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms