Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
IGHV3-33P01772 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms