Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAPBO95292 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
VAPBO95292 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPBO95292 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPBO95292 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPBO95292 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPBO95292 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPBO95292 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPBO95292 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPBO95292 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPBO95292 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPBO95292 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPBO95292 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPBO95292 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
VAPBO95292 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms