Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCXO43602 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCXO43602 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCXO43602 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCXO43602 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCXO43602 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCXO43602 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCXO43602 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCXO43602 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCXO43602 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DCXO43602 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCXO43602 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCXO43602 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCXO43602 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCXO43602 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCXO43602 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCXO43602 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCXO43602 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCXO43602 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCXO43602 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCXO43602 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCXO43602 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCXO43602 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DCXO43602 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms