Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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