Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GOLGA8SH3BPF8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms