Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
XIRP2A4UGR9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms