Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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TRBV2A0A0J9YWF9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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