Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
YBX2Q9Y2T7 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms