Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms