Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SETD1BQ9UPS6 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms