Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLIP2Q9UDT6 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms