Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HMG20BQ9P0W2 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms