Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM248Q9NWD8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM248Q9NWD8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms