Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms