Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CISHQ9NSE2 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms