Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNX15Q9NRS6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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