Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PFDN4Q9NQP4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PFDN4Q9NQP4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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