Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED4Q9NPJ6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms