Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C11orf49Q9H6J7 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms