Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PHACTR1Q9C0D0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms