Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SEMA4CQ9C0C4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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SEMA4CQ9C0C4 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SEMA4CQ9C0C4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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