Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOPX-209ENST00000508121 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079779.3-218ENST00000612487 940 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC012442.3-201ENST00000636053 940 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDAD1P4-201ENST00000418445 1645 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR6B2-201ENST00000402971 1492 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL138831.3-201ENST00000623656 1458 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMED6-201ENST00000288025 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM59-203ENST00000371341 1116 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms