Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VN1R3Q9BXE9 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VN1R3Q9BXE9 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms