Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMEM79Q9BSE2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM79Q9BSE2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms