Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOPXQ9BPY8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms