Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CHP1Q99653 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms