Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms