Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms