Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CSRNP1Q96S65 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms