Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX27Q96L92 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX27Q96L92 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms