Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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