Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SIRT1Q96EB6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms